朱常洛的生母是孝靖皇后王氏，明神宗妃。孝靖皇后原为慈宁宫宫女，万历九年明神宗往慈宁宫向李太后（明神宗生母）请安，一时兴起宠幸了她，后生下一个男孩，就是明光宗朱常洛。封恭妃，万历三十四年年晋封贵妃，同年被封皇贵妃，万历三十九年九月去世。其孙明熹宗登基后，追封为孝靖温懿敬让贞慈参天胤圣皇太后，后改称皇后。
万历九年(1581年)，神宗在其生母李太后的慈宁宫中私幸宫女王氏，后来王氏有孕，神宗忌讳这件事情而不敢承认，但在内起居注中记载了这件事情，并有当时赏赐给王氏的实物为证，再加李太后盼孙心切，比较后面被迫承认这件事情。万历十年(1591)，神宗册封宫女王氏为恭妃，于万历十年(1591)八月生子，是为神宗长子，取名常洛。
朱常洛不是王皇后生的，是客氏所生。